Identification of the A and C genomes of amphidiploid Brassica napus (oilseed rape)

A genetic linkage map consisting of 399 RFLP-defined loci was generated from a cross between resynthesized Brassica napus (an interspecific B. rapa × B. oleracea hybrid) and "natural" oilseed rape. The majority of loci exhibited disomic inheritance of parental alleles demonstrating that B. rapa chromosomes were each pairing exclusively with recognisable A-genome homologues in B. napus and that B. oleracea chromosomes were pairing similarly with C-genome homologues. This behaviour identified the 10 A genome and 9 C genome linkage groups of B. napus and demonstrated that the nuclear genomes of B. napus, B. rapa, and B. oleracea have remained essentially unaltered since the formation of the amphidiploid species, B. napus. A range of unusual marker patterns, which could be explained by aneuploidy and nonreciprocal translocations, were observed in the mapping population. These chromosome abnormalities were probably caused by associations between homoeologous chromosomes at meiosis in the resynthesized parent and the F₁ plant leading to nondisjunction and homoeologous recombination.Key words: genetic linkage map, homoeologous recombination, Brassica rapa, Brassica oleracea, genome organization.

Une carte génétique comprenant 339 marqueurs RFLP a été réalisée suite à un croisement entre un Brassica napus resynthétisé (un hybride interspécifique entre le B. rapa et le B. oleracea) et le colza « naturel ». La majorité des loci présentent une transmission disomique des allèles parentaux. Ceci montre que les chromosomes du B. rapa reconnaissent et s'apparient exclusivement avec leurs homologues du génome A chez le B. napus tout comme les chromosomes du B. oleracea s'apparient avec leurs homologues du génome C chez le B. napus. Ce comportement a permis d'identifier les 10 groupes de liaison du génome A et les 9 groupes de liaison du génome C chez le B. napus. De plus, ceci indique que les génomes nucléaires de B. napus, B. rapa et B. oleracea sont demeurés essentiellement inchangés depuis la formation de l'espèce amphiploïde B. napus. Différents motifs inhabituels ont été observés dans cette population et ceux-ci pourraient être le résultat d'aneuploïdie ou de translocations non-réciproques. Ces anomalies chromosomiques sont vraisemblablement causées par suite d'associations entre chromosomes homéologues survenant lors de la méiose chez le parent synthétique et chez les individus F₁ menant ainsi à la non-disjonction et à la recombinaison homéologue. Mots clés : carte génétique, recombinaison homéologue, Brassica rapa, Brassica oleracea, organisation génomique.[Traduit par la Rédaction]