Dunham I., Kundaje A., Aldred S. F., Collins P. J., Davis C. A., Doyle F., Epstein C. B., Frietze S., Harrow J., Kaul R., Khatun J., Lajoie B. R., Landt S. G., Lee B.-K., Pauli F., Rosenbloom K. R., Sabo P., Safi A., Sanyal A., Shoresh N., Simon J. M., Song L., Trinklein N. D., Altshuler R. C., Birney E., Brown J. B., Cheng C., Djebali S., Dong X., Dunham I., Ernst J., Furey T. S., Gerstein M., Giardine B., Greven M., Hardison R. C., Harris R. S., Herrero J., Hoffman M. M., Iyer S., Kellis M., Khatun J., Kheradpour P., Kundaje A., Lassmann T., Li Q., Lin X., Marinov G. K., Merkel A., Mortazavi A., Parker S. C. J., Reddy T. E., Rozowsky J., Schlesinger F., Thurman R. E., Wang J., Ward L. D., Whitfield T. W., Wilder S. P., Wu W., Xi H. S., Yip K. Y., Zhuang J., Bernstein B. E., Birney E., Dunham I., Green E. D., Gunter C., Snyder M., Pazin M. J., Lowdon R. F., Dillon L. A. L., Adams L. B., Kelly C. J., Zhang J., Wexler J. R., Green E. D., Good P. J., Feingold E. A., Bernstein B. E., Birney E., Crawford G. E., Dekker J., Elnitski L., Farnham P. J., Gerstein M., Giddings M. C., Gingeras T. R., Green E. D., Guigó R., Hardison R. C., Hubbard T. J., Kellis M., Kent W. J., Lieb J. D., Margulies E. H., Myers R. M., Snyder M., Stamatoyannopoulos J. A., Tenenbaum S. A., Weng Z., White K. P., Wold B., Khatun J., Yu Y., Wrobel J., Risk B. A., Gunawardena H. P., Kuiper H. C., Maier C. W., Xie L., Chen X., Giddings M. C., Bernstein B. E., Epstein C. B., Shoresh N., Ernst J., Kheradpour P., Mikkelsen T. S., Gillespie S., Goren A., Ram O., Zhang X., Wang L., Issner R., Coyne M. J., Durham T., Ku M., Truong T., Ward L. D., Altshuler R. C., Eaton M. L., Kellis M., Djebali S., Davis C. A., Merkel A., Dobin A., Lassmann T., Mortazavi A., Tanzer A., Lagarde J., Lin W., Schlesinger F., Xue C., Marinov G. K., Khatun J., Williams B. A., Zaleski C., Rozowsky J., Röder M., Kokocinski F., Abdelhamid R. F., Alioto T., Antoshechkin I., Baer M. T., Batut P., Bell I., Bell K., Chakrabortty S., Chen X., Chrast J., Curado J., Derrien T., Drenkow J., Dumais E., Dumais J., Duttagupta R., Fastuca M., Fejes-Toth K., Ferreira P., Foissac S., Fullwood M. J., Gao H., Gonzalez D., Gordon A., Gunawardena H. P., Howald C., Jha S., Johnson R., Kapranov P., King B., Kingswood C., Li G., Luo O. J., Park E., Preall J. B., Presaud K., Ribeca P., Risk B. A., Robyr D., Ruan X., Sammeth M., Sandhu K. S., Schaeffer L., See L.-H., Shahab A., Skancke J., Suzuki A. M., Takahashi H., Tilgner H., Trout D., Walters N., Wang H., Wrobel J., Yu Y., Hayashizaki Y., Harrow J., Gerstein M., Hubbard T. J., Reymond A., Antonarakis S. E., Hannon G. J., Giddings M. C., Ruan Y., Wold B., Carninci P., Guigó R., Gingeras T. R., Rosenbloom K. R., Sloan C. A., Learned K., Malladi V. S., Wong M. C., Barber G. P., Cline M. S., Dreszer T. R., Heitner S. G., Karolchik D., Kent W. J., Kirkup V. M., Meyer L. R., Long J. C., Maddren M., Raney B. J., Furey T. S., Song L., Grasfeder L. L., Giresi P. G., Lee B.-K., Battenhouse A., Sheffield N. C., Simon J. M., Showers K. A., Safi A., London D., Bhinge A. A., Shestak C., Schaner M. R., Ki Kim S., Zhang Z. Z., Mieczkowski P. A., Mieczkowska J. O., Liu Z., McDaniell R. M., Ni Y., Rashid N. U., Kim M. J., Adar S., Zhang Z., Wang T., Winter D., Keefe D., Birney E., Iyer V. R., Lieb J. D., Crawford G. E., Li G., Sandhu K. S., Zheng M., Wang P., Luo O. J., Shahab A., Fullwood M. J., Ruan X., Ruan Y., Myers R. M., Pauli F., Williams B. A., Gertz J., Marinov G. K., Reddy T. E., Vielmetter J., Partridge E., Trout D., Varley K. E., Gasper C., Bansal A., Pepke S., Jain P., Amrhein H., Bowling K. M., Anaya M., Cross M. K., King B., Muratet M. A., Antoshechkin I., Newberry K. M., McCue K., Nesmith A. S., Fisher-Aylor K. I., Pusey B., DeSalvo G., Parker S. L., Balasubramanian S., Davis N. S., Meadows S. K., Eggleston T., Gunter C., Newberry J. S., Levy S. E., Absher D. M., Mortazavi A., Wong W. H., Wold B., Blow M. J., Visel A., Pennachio L. A., Elnitski L., Margulies E. H., Parker S. C. J., Petrykowska H. M., Abyzov A., Aken B., Barrell D., Barson G., Berry A., Bignell A., Boychenko V., Bussotti G., Chrast J., Davidson C., Derrien T., Despacio-Reyes G., Diekhans M., Ezkurdia I., Frankish A., Gilbert J., Gonzalez J. M., Griffiths E., Harte R., Hendrix D. A., Howald C., Hunt T., Jungreis I., Kay M., Khurana E., Kokocinski F., Leng J., Lin M. F., Loveland J., Lu Z., Manthravadi D., Mariotti M., Mudge J., Mukherjee G., Notredame C., Pei B., Rodriguez J. M., Saunders G., Sboner A., Searle S., Sisu C., Snow C., Steward C., Tanzer A., Tapanari E., Tress M. L., van Baren M. J., Walters N., Washietl S., Wilming L., Zadissa A., Zhang Z., Brent M., Haussler D., Kellis M., Valencia A., Gerstein M., Reymond A., Guigó R., Harrow J., Hubbard T. J., Landt S. G., Frietze S., Abyzov A., Addleman N., Alexander R. P., Auerbach R. K., Balasubramanian S., Bettinger K., Bhardwaj N., Boyle A. P., Cao A. R., Cayting P., Charos A., Cheng Y., Cheng C., Eastman C., Euskirchen G., Fleming J. D., Grubert F., Habegger L., Hariharan M., Harmanci A., Iyengar S., Jin V. X., Karczewski K. J., Kasowski M., Lacroute P., Lam H., Lamarre-Vincent N., Leng J., Lian J., Lindahl-Allen M., Min R., Miotto B., Monahan H., Moqtaderi Z., Mu X. J., O’Geen H., Ouyang Z., Patacsil D., Pei B., Raha D., Ramirez L., Reed B., Rozowsky J., Sboner A., Shi M., Sisu C., Slifer T., Witt H., Wu L., Xu X., Yan K.-K., Yang X., Yip K. Y., Zhang Z., Struhl K., Weissman S. M., Gerstein M., Farnham P. J., Snyder M., Tenenbaum S. A., Penalva L. O., Doyle F., Karmakar S., Landt S. G., Bhanvadia R. R., Choudhury A., Domanus M., Ma L., Moran J., Patacsil D., Slifer T., Victorsen A., Yang X., Snyder M., White K. P., Auer T., Centanin L., Eichenlaub M., Gruhl F., Heermann S., Hoeckendorf B., Inoue D., Kellner T., Kirchmaier S., Mueller C., Reinhardt R., Schertel L., Schneider S., Sinn R., Wittbrodt B., Wittbrodt J., Weng Z., Whitfield T. W., Wang J., Collins P. J., Aldred S. F., Trinklein N. D., Partridge E. C., Myers R. M., Dekker J., Jain G., Lajoie B. R., Sanyal A., Balasundaram G., Bates D. L., Byron R., Canfield T. K., Diegel M. J., Dunn D., Ebersol A. K., Frum T., Garg K., Gist E., Hansen R. S., Boatman L., Haugen E., Humbert R., Jain G., Johnson A. K., Johnson E. M., Kutyavin T. V., Lajoie B. R., Lee K., Lotakis D., Maurano M. T., Neph S. J., Neri F. V., Nguyen E. D., Qu H., Reynolds A. P., Roach V., Rynes E., Sabo P., Sanchez M. E., Sandstrom R. S., Sanyal A., Shafer A. O., Stergachis A. B., Thomas S., Thurman R. E., Vernot B., Vierstra J., Vong S., Wang H., Weaver M. A., Yan Y., Zhang M., Akey J. M., Bender M., Dorschner M. O., Groudine M., MacCoss M. J., Navas P., Stamatoyannopoulos G., Kaul R., Dekker J., Stamatoyannopoulos J. A., Dunham I., Beal K., Brazma A., Flicek P., Herrero J., Johnson N., Keefe D., Lukk M., Luscombe N. M., Sobral D., Vaquerizas J. M., Wilder S. P., Batzoglou S., Sidow A., Hussami N., Kyriazopoulou-Panagiotopoulou S., Libbrecht M. W., Schaub M. A., Kundaje A., Hardison R. C., Miller W., Giardine B., Harris R. S., Wu W., Bickel P. J., Banfai B., Boley N. P., Brown J. B., Huang H., Li Q., Li J. J., Noble W. S., Bilmes J. A., Buske O. J., Hoffman M. M., Sahu A. D., Kharchenko P. V., Park P. J., Baker D., Taylor J., Weng Z., Iyer S., Dong X., Greven M., Lin X., Wang J., Xi H. S., Zhuang J., Gerstein M., Alexander R. P., Balasubramanian S., Cheng C., Harmanci A., Lochovsky L., Min R., Mu X. J., Rozowsky J., Yan K.-K., Yip K. Y., Birney E.ENCODE Project Consortium, An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. Nature 489, 57–74 (2012).